В настоящей работе представлены результаты исследования биоразнообразия почвенных микроскопических грибов, выделенных в осенне-летний период из ризосферы галофитных растений, произрастающих на территории Акмолинской , Алматинской и Туркестанской областей (Казахстан). Для создания биопрепаратов, обеспечивающих стимуляцию роста и защиту посадочного материала в лесопарковых зонах и садоводческих хозяйствах, нами были выделены и проиденфицированы 352 культивируемых микроорганизмов, принадлежащих к родам Bacillus, Pseudomonas, Arthrobacter, Curtobacterium, Erwinia и др. Всего нами было изучено 8 микроскопических грибов. Выделение и культивирование грибов проводили на среде Чапека при 28 °С ± 2 °С в течение 10 дней. Кроме использования методов исследования культурально-морфологических признаков грибов, были также применены и молекулярно-генетические. Идентификация с использованием метода сравнения нуклеотидных последовательностей, кодирующих ген 18SрРНК выделенных нами культур, показала, что разнообразие их ограничено представителями лишь трех родов: Fusarium, Alternaria, Penicillium, с доминированием последних двух.